Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trappc5Q9CQA1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc5Q9CQA1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc5Q9CQA1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc5Q9CQA1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms