Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufa3Q9CQ91 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa3Q9CQ91 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms