Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQ90 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQ90 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CQ90 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQ90 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQ90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms