Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700129C05RikQ9CQ77 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.2 ms