Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd2Q9CQ48 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nudcd2Q9CQ48 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nudcd2Q9CQ48 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms