Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab2Q9CQ46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab2Q9CQ46 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab2Q9CQ46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab2Q9CQ46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Efcab2Q9CQ46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Efcab2Q9CQ46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efcab2Q9CQ46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms