Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med21Q9CQ39 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med21Q9CQ39 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med21Q9CQ39 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med21Q9CQ39 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms