Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnaseh2cQ9CQ18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms