Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg3Q9CPX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg3Q9CPX6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atg3Q9CPX6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms