Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim26Q99PN3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim26Q99PN3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim26Q99PN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms