Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2a1Q99PM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms