Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b1Q99NB9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b1Q99NB9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b1Q99NB9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms