Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramel1Q99MW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramel1Q99MW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms