Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BrapQ99MP8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrapQ99MP8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms