Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CalcbQ99MP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CalcbQ99MP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CalcbQ99MP3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms