Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkd1Q99MH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkd1Q99MH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkd1Q99MH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms