Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd3Q99MD6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Txnrd3Q99MD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Txnrd3Q99MD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms