Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr3Q99MB1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr3Q99MB1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr3Q99MB1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms