Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cstf3Q99LI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cstf3Q99LI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Cstf3Q99LI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms