Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GatbQ99JT1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms