Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfxn1Q99JR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sfxn1Q99JR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfxn1Q99JR1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfxn1Q99JR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms