Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdelr1Q99JH8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdelr1Q99JH8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdelr1Q99JH8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms