Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc8b1Q925Q3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc8b1Q925Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc8b1Q925Q3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms