Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo1Q924W9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Lmo1Q924W9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Lmo1Q924W9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Lmo1Q924W9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Lmo1Q924W9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo1Q924W9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms