Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ferd3lQ923Z4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ferd3lQ923Z4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ferd3lQ923Z4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms