Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim7Q923T7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim7Q923T7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim7Q923T7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim7Q923T7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms