Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NelfcdQ922L6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NelfcdQ922L6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms