Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Traf7Q922B6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf7Q922B6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf7Q922B6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf7Q922B6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms