Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp4Q921I6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms