Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prb1Q91X93 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prb1Q91X93 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prb1Q91X93 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prb1Q91X93 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms