Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD2

Trpv6, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv6Q91WD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpv6Q91WD2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv6Q91WD2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv6Q91WD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv6Q91WD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms