Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms