Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClmpQ8R373 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClmpQ8R373 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms