Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkl1Q8K4J6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkl1Q8K4J6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkl1Q8K4J6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms