Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolbQ8K409 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolbQ8K409 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms