Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MyripQ8K3I4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MyripQ8K3I4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms