Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf39Q8K2Z2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf39Q8K2Z2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf39Q8K2Z2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf39Q8K2Z2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms