Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Depp1Q8K2F3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms