Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Neil3Q8K203 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Neil3Q8K203 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Neil3Q8K203 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms