Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a11Q8K0E3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a11Q8K0E3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc5a11Q8K0E3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms