Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm17Q8JZX4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm17Q8JZX4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm17Q8JZX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbm17Q8JZX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbm17Q8JZX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbm17Q8JZX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm17Q8JZX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm17Q8JZX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms