Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Q4Q8HWB2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q4Q8HWB2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q4Q8HWB2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms