Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20aQ8CID3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20aQ8CID3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam20aQ8CID3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms