Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog3Q8CI04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog3Q8CI04 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog3Q8CI04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms