Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rftn2Q8CHX7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rftn2Q8CHX7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rftn2Q8CHX7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms