Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CherpQ8CGZ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CherpQ8CGZ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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