Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hpf1Q8CFE2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hpf1Q8CFE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hpf1Q8CFE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Hpf1Q8CFE2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hpf1Q8CFE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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