Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc8Q8CFD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc8Q8CFD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc8Q8CFD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc8Q8CFD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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