Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx8Q8CFD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx8Q8CFD4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx8Q8CFD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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