Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl11Q8CE33 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl11Q8CE33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl11Q8CE33 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl11Q8CE33 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms